2017/01 썸네일형 리스트형 awk 사용 15기가 짜리 매트릭스를 다뤄야 하는데, R로는 불러오기조차 힘들어서 리눅스로 해결해야 했다. ex) 열 출력awk '{print $1" "$3}' filename > 1_3_cols.txt$1 $3 사이의 " "를 두어 열과 열 사이의 공백을 두었다. 행 출력awk 'FNR == 1 {print}' filename > 1_row.txt 더보기 precision pharmacological medicine problem 문제를 정의하자. Genomic + Clinical feature를 포함해서 어떤 특징들을 갖는 tumor가 무슨 약물에 대해서 어떠한 특징들을 갖게 되는가? 더보기 어려운 것이다 생물학은 어려운 것 같다. 온통 가정과 불확실 투성이다.변화의 요인이 될만한게 너무 많다. 물리도 마찬가지지만, 생물보단 가정해서 문제를 풀어나가기 쉬운 것 같다. 더보기 Pharmacogenomic agreement between two cancer cell line data sets http://www.nature.com/nature/journal/v528/n7580/full/nature15736.html cancer cell line과 drug response에 대한 대표적인 두 가지 데이터베이스인 CCLE와 GDSC에 대한 비교 분석이다. 이전의 논문들이 두 기관에서 나오는 데이터의 consistency에 대해 의문을 제기한 데 반해 본 논문은 '조건부' 일치에 대한 주장을 한다. 마저 읽고 정리하겠다... 더보기 tar.gz 한번에 압축 풀기 tar.gz 여러 파일 한번에 압축 풀기 계속 까먹는다. find . -name "*.tar.gz" -exec tar xzvf {} \; 더보기 이전 1 다음